Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFE3P19532 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms