Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms