Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms