Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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