Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB15A6NHN6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms