Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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