Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms