Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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