Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNTN3Q9P232 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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