Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms