Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLF1Q9BQI6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms