Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3AQ96ST3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms