Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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