Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms