Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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LINC00526Q96FQ7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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LINC00526Q96FQ7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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LINC00526Q96FQ7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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LINC00526Q96FQ7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC00526Q96FQ7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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