Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STAMBPL1Q96FJ0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms