Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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