Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MYRIPQ8NFW9 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms