Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00523Q86TU6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms