Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms