Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms