Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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