Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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