Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms