Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITSN1Q15811 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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