Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms