Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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