Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms