Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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