Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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