Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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