Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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CUL4AQ13619 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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