Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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