Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms