Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TLE4Q04727 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms