Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms