Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms