Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK16Q00536 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK16Q00536 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms