Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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