Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC3P51654 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms