Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms