Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms