Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms