Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms