Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms