Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms