Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms