Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HTR2AP28223 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms