Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms