Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms